这龟鹤丘井阵的来历还颇有一番历史渊源，讲述起来也要颇费一番口舌，但因其事关重大，在这里也不得不对其进行一番粗解。
龟鹤丘井阵其实分为两个层面，最早可以追述到远古时期，它的雏形是由人文始祖轩辕黄帝创造的丘井法阵，这相当于是低配版的初级阵型，也是迄今为上，有记载的最古老、最基本的阵型。后来经过诸葛亮不断完善提升，并加入了一些元素，最终成形为龟鹤丘井阵的终极版本。
为了把这龟鹤丘井阵表述清楚，让大家有更容易理解，只能将其分为两个层面来阐述。先说这最基本的丘井阵，据史料记载：“黄帝兵法，世传握奇文”，“考其辞云：四为奇，四为正，余为握奇。奇，余零也。”意思是说这种“握奇阵”是轩辕黄帝首创的阵法，实际上是将一支军队分为八个小方阵，其中有四正、四奇，总共为八阵，按“井”字形排列、环形配置，大将居中掌握，称为“握奇”。
而阵中的军队环卫前后左右，形成八个活动区域。能够达到一处受敌，多方可以支援的目的。“而其阵型就像一个“井”字，一旦分开，就是九个独立的区域，上下左右中五方为阵法之地，其余四角为闲置之所”。
“前、后、左、右、中、共分为五个主要的正方位，加上四角的辅助区域，一共是九处的区域，这九个区域既可以紧密联系在一起，又可独立成阵，自行御敌。若除去中央大将指挥的位置，则又可以变成是相辅相承的八个阵型，根据站场的变化和需要，进行轮转。
这样这个阵型就集齐了五、八、九之数，阵法也就有了千变万化的基础。临敌交锋的时候，可以灵活运用，依势而变，前阵可变为后阵，后阵也可以转换为前阵，就这样旋转不休，诸部相连，斗阵虽乱，而阵法却不为所乱！这便是丘井阵的雏形，也是轩辕黄帝创建丘井阵的初衷！”
这样一来，大家可能会觉得中间实为空虚，但其实天地万物的变化就在虚虚实实之间，虚实也可以相互转换，虚是实之初，而实是虚之果，所谓万变不离其宗，就是这个道理。
而在丘井阵当中，这中央是指挥四方八面的核心和关键，从八面之内的兵将来看，它确实是虚的，而其实这中央才是四面八方起变化的开端！就像是电脑的中央处理器，能够发出明确的指令，指挥其他几个板块的运动。
四个正位兵多将广、刀枪林立，这是实打实看得到的险境，而角上四个位置看似平静，但那里面更多的是看不到的陷阱，而这些并非一成不变，它会根据战场
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