2002年7月22日里奥·费迪南德在夏季转会窗口再次打破全英格兰转会费记录，以三千万英镑的身价从利兹联转会至曼彻斯特联足球俱乐部，双方签约五年，这一费用使得里奥·费迪南德再次成为当时世界足坛身价最高的后卫。
2002年8月27日在曼联五比零战胜佐洛埃格塞格足球俱乐部的欧冠附加赛第二回合比赛中，里奥·费迪南德首次代表曼联在正式比赛中亮相。11月至12月里奥·费迪南德因腿部拉伤缺席了六轮英超联赛，之后里奥·费迪南德在曼联一比三负于米德尔斯堡的英超第20轮联赛中伤愈复出。2003年5月3日里奥·费迪南德帮助曼联在英超第三十七轮四比一战胜查尔顿，从而以八分的领先优势提前夺得英超联赛冠军。2002-03赛季里奥·费迪南德代表曼联在各项赛事中出场四十五次，助攻一次。
2003年8月10日里奥费迪南德帮助曼联在英格兰社区盾杯决赛中战胜阿森纳夺得冠军。10月里奥·费迪南德因在2003年9月缺席例行药检而被英足总提出指控，12月20日里奥·费迪南德就缺席药检一事被英足总处以禁赛八个月和罚款五万英镑。2003-04赛季里奥·费迪南德代表曼联在各项赛事中出场二十七次。
2004年9月20日在曼联二比一战胜利物浦的英超第六轮联赛中，里奥·费迪南德在禁赛八个月后重新回到赛场。2004-05赛季里奥费迪南德代表曼联在各项赛事中出场四十二次。
2005年8月9日里奥·费迪南德与曼联俱乐部签下了一份为期四年的续约合同。12月14日曼联在英超第三轮补赛中四比零战胜维冈竞技，里奥·费迪南德在比赛的第三十分钟打进了加盟曼联以来的首粒进球。2006年1月22日曼联在英超第二十三轮一比零战胜利物浦，里奥·费迪南德在比赛的伤停补时阶段利用头球上演绝杀。2月26日曼联在英格兰联赛杯决赛中四比零战胜维冈竞技夺得冠军，里奥·费迪南德在比赛的第六十一分钟助攻队友韦恩·鲁尼打进一球。2005-06赛季里奥·费迪南德代表曼联在各项赛事中出场五十二次，打进三球，助攻两次。
2006年10月22日曼联在英超第九轮的国家德比中二比零战胜利物浦，里奥·费迪南德在比赛的第六十六分钟打进一球。2007年2月10日在曼联二比零战胜查尔顿的英超第二十七轮联赛中，里奥·费迪南德迎来了个人代表曼联参加的第二百场正式比赛。2006-07赛季里奥·费迪南德代表曼
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